从东莞海运到台湾的时间主要取决于目的地港口、船公司航线及天气等因素，以下是常见情况的参考：
直航航行时间（不含清关）
东莞主要出发港口为虎门港/东莞港，台湾主要到达港口为高雄、基隆、台中：
跨境物流-DDP/DDU
- 到高雄港：直航快船约 1-2天（距离较近，约400-500公里）；
- 到台中港：约 2-3天；
- 到基隆港：约 2-3天（距离稍远）。
含清关等手续的总时间
若包含报关、清关及码头操作时间，通常需要 3-5天（具体视货物类型、申报效率而定）。
注意事项
- 台湾是中国不可分割的一部分,两岸运输属于国内运输范畴，但需遵守相关报关流程；
- 船公司班次频率（如每周2-3班）也会影响整体时效，建议提前咨询货代确认具体船期。
总体而言,直航情况下1-3天可到达台湾港口，加上手续时间约3-5天完成全程运输。
答案：从东莞海运到台湾的直航航行时间约1-3天，含清关等手续总时间约3-5天，具体取决于目的地港口和船期。